Cùng với việc quan tâm đào tạo phát triển nguồn nhân lực, trong thời gian qua, Bộ Y tế cũng đã quan tâm tăng cường công tác đào tạo liên tục về chuyên môn.
Năm 2008, Bộ Y tế đã ban hành Thông tư số 07/2008/TT-BYT hướng dẫn công tác đào tạo liên tục; gồm đào tạo bồi dưỡng để cập nhật, bổ sung kiến thức, kỹ thuật thuộc lĩnh vực chuyên môn đảm nhận, thời gian được đào tạo mỗi năm tối thiểu là 24 giờ thực học, trong 5 năm mỗi cán bộ y tế phải tham gia học tập và tích lỹ đủ thời gian đào tạo liên tục ít nhất là 120 giờ thuộc lĩnh vực chuyên môn, nghiệp vụ đang hành nghề. Đồng thời với công tác đào tạo liên tục, việc đào tạo chuyên môn sâu (Chuyên khoa 1, Chuyên khoa 2, Thạc sỹ, Tiến sỹ) cũng được quan tâm thông qua các dự án, chương trình mục tiêu.
Cùng với công tác đào tạo nâng cao năng lực chuyên môn, công tác quản lý cũng được quan tâm nhằm tạo điều kiện cho đội ngũ nhân lực y tế cập nhật kiến thức mới về năng lực quản lý trong tình hình mới. Hiện nay, Bộ Y tế đã có Quyết định thành lập hai Trung tâm đào tạo cán bộ quản lý y tế tại Hà Nội và thành phố Hồ Chí Minh.