An Phú là địa phương có tỷ lệ học sinh bỏ học cao nhất tỉnh: Năm học 2006-2007, số học sinh bậc tiểu học bỏ học chiếm tới 3,41%, bậc THCS là 13,26%. Năm học 2007-2008, huyện đã tập trung chỉ đạo ngành giáo dục phối hợp với chính quyền các xã, thị trấn, các đoàn thể thực hiện các biện pháp hạn chế tình trạng học sinh bỏ học như: Tăng cường đầu tư xây dựng cơ sở vật chất, trang thiết bị để nâng cao chất lượng dạy, học; Hỗ trợ học sinh có hoàn cảnh khó khăn... Vì vậy, tình trạng học sinh bỏ học đã giảm. Tính đến đầu tháng 5.2008, tỷ lệ học sinh bỏ học ở bậc tiểu học giảm xuống còn 0,89%, THCS còn 9,67%. Ban ghi nhận nỗ lực của huyện, đồng thời đề nghị tiếp tục có biện pháp hữu hiệu hạn chế tình trạng học sinh bỏ học.