Bệnh viện Nhi Thanh Hoá được thành lập năm 2001 với tổng số vốn dự kiến đầu tư xây dựng là 110.737 triệu đồng, quy mô 500 giường bệnh, gồm 34 khoa, phòng chức năng nhưng đến tháng 5.2007 mới chính thức hoạt động tại cơ sở mới. Hiện mới hoàn thành và đưa vào sử dụng khu khám bệnh, hành chính và chuẩn bị đưa vào sử dụng khu xét nghiệm, phòng mổ, chẩn đoán; Các hạng mục khác chưa được cấp vốn xây dựng. Sau 6 tháng hoạt động, bệnh viện đã khám cho 13.893 người, phát thuốc điều trị ngoại trú cho 7.097 lượt người, phẫu thuật 669 ca và không có phải chuyển lên tuyến trên. Ban kiến nghị Bộ Y tế cho phép và hỗ trợ xây dựng Bệnh viện Nhi Thanh Hoá thành bệnh viện vệ tinh của Bệnh viện Nhi Trung ương; Chính phủ cho phép sử dụng nguồn trái phiếu để nhanh chóng hoàn thiện bệnh viện; UBND tỉnh tập trung nguồn vốn sớm đưa vào sử dụng các hạng mục công trình.