Trong 2 năm 2007-2008, Ngành Y tế được cấp bổ sung khoảng 11 tỷ đồng từ nguồn dự phòng ngân sách tỉnh. Nguồn kinh phí này được thực hiện hiệu quả cho công tác phòng chống dịch bệnh, trợ cấp y tế thôn, bản và KCB cho trẻ dưới 6 tuổi… Tuy nhiên, việc cấp bổ sung kinh phí trong quá trình thực hiện một số nhiệm vụ đột xuất chưa kịp thời; Nguồn kinh phí chưa đáp ứng yêu cầu nhiệm vụ chuyên môn. Dự án y tế nông thôn đầu tư XDCB tại Vĩnh Phúc sử dụng nguồn vốn vay của Ngân hàng phát triển Châu Á (ADB) và vốn đối ứng của tỉnh với tổng số vốn 56 tỷ đồng. Tổng số 22 hạng mục, công trình được xây dựng từ năm 2004-2008 đều đã hoàn thành đưa vào sử dụng, hoạt động có hiệu quả. Ban yêu cầu cần ổn định dự toán ngân sách ngay từ đầu năm; Phối hợp điều hành giữa các ngành để đạt hiệu quả cao nhất trong quá trình thực hiện.