Việc quy định quỹ BHYT thanh toán chi phí vận chuyển bệnh nhân BHYT là một trong những điểm mới của chính sách BHYT, tạo điều kiện để hỗ trợ về mặt tài chính cho người bệnh, tuy nhiên trong điều kiện khả năng thanh toán của quỹ BHYT còn có hạn, việc quy định cho phép thanh toán chi phí vận chuyển bệnh nhân BHYT từ tuyến huyện lên tuyến tỉnh chỉ mang ý nghĩa hỗ trợ cho người bệnh và cơ sở khám chữa bệnh có phương tiện vận chuyển bệnh nhân chuyên dụng, các phương tiện, máy móc cần thiết cho quá trình cấp cứu bệnh nhân, chuyển tuyến khi vượt quá khả năng chuyên môn của cơ sở y tế.
Theo quy định tại Điểm c, Khoản 1, Điều 21 Luật BHYT, đối tượng thuộc hộ gia đình cận nghèo đã được quỹ BHYT chi trả chi phí vận chuyển từ tuyến huyện lên tuyến trên như hộ nghèo trong trường hợp cấp cứu hoặc khi đang điều trị nội trú phải chuyển tuyến chuyên môn kỹ thuật .
Để hỗ trợ những đối tượng này, Thủ tướng Chính phủ đã có quyết định số 14/2012/QĐ-TTg ngày 01/3/2012 sửa đổi, bổ sung Quyết định số 139/2002/QĐ-TTg về khám chữa bệnh cho người nghèo. Theo quyết định này, Quỹ khám, chữa bệnh cho người nghèo sẽ hỗ trợ tiền ăn, tiền vận chuyển người bệnh từ nhà tới cơ sở y tế và từ cơ sở y tế về nhà, hỗ trợ chi phí khám chữa bệnh BHYT cùng chi trả khi chi phí đồng chi trả từ 100.000 đồng trở lên cho người nghèo, người dân tộc thiểu số sinh sống ở vùng khó khăn, người thuộc diện bảo trợ xã hội.