Trong thời gian qua, số lượng các cơ quan, tổ chức bên trong các Bộ, cơ quan ngang Bộ, cơ quan thuộc Chính phủ và các Sở, ngành ở địa phương  tăng đáng kể, đặc biệt là tổ chức Tổng cục, Cục thuộc Bộ, Cục thuộc  Tổng cục, Chi cục thuộc Sở, nên mục tiêu bảo đảm bộ máy tinh gọn còn hạn chế. Nguyên nhân chủ yếu của việc tăng thêm tổ chức là:

Thứ nhất, để đáp ứng yêu cầu quản lý nhà nước, cần thành lập các tổ chức  chuyên sâu, ổn định ở các ngành, lĩnh vực trong mô hình tổ chức Bộ, Sở quản lý đa ngành, đa lĩnh vực.

Thứ hai, chấp hành các Luật chuyên ngành, các Quyết định của Thủ tướng Chính phủ phê duyệt đề án, trong đó có quy định về thành lập tổ chức, nên khi triển khai thực hiện phải thành lập các tổ chức theo quy định.

Thứ ba, chưa tuân thủ các quy định về thành lập các tổ chức hành chính. Nhiều tổ chức hành chính thuộc cơ cấu bên trong các tổ chức thuộc Bộ, ngành, địa phương được thành lập còn chưa xuất phát từ yêu cầu thực tiễn mà xuất phát từ tính cục bộ hoặc để giải quyết chế độ chính sách cho cán bộ, công chức của Bộ, ngành, địa phương.

Để khắc phục tình trạng nêu trên, Chính phủ, Thủ tướng Chính phủ chỉ đạo các Bộ, ngành, địa phương nghiêm túc thực hiện:

Kết luận số 64-KL/TW ngày 28/5/2013 Hội nghị lần thứ bảy Ban Chấp hành Trung ương khóa XI một số vấn đề về tiếp tục đổi mới, hoàn thiện hệ thống chính trị từ Trung ương đến cơ sở, trong đó đề ra chủ trương: “Tiếp tục đổi mới hoạt động của Chính phủ theo hướng xây dựng nền hành chính trong sạch, vững mạnh, quản lý thống nhất, thông suốt, tinh gọn, hợp lý; hiệu lực, hiệu quả các cơ quan nhà nước, khắc phục tình trạng buông lỏng trên một số lĩnh vực. Tiếp tục đẩy mạnh cải cách hành chính, chế độ công vụ”.

Nghị quyết 30c/NQ-CP ngày 08/11/2011 của Chính phủ về Chương trình tổng thể cải cách hành chính nhà nước giai đoạn 2011-2020, trong đó đưa ra mục tiêu: “Xây dựng hệ thống các cơ quan hành chính nhà nước từ Trung ương đến cơ sở thông suốt, trong sạch, vững mạnh, hiện đại, hiệu lực, hiệu quả”, và một trong những nhiệm vụ là cải cách tổ chức bộ máy hành chính: “Tiến hành tổng rà soát về vị trí, chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn, cơ cấu tổ chức và biên chế hiện có của các Bộ, cơ quan ngang Bộ, cơ quan thuộc Chính phủ, Ủy ban nhân dân các cấp, các cơ quan chuyên môn thuộc Ủy ban nhân dân cấp tỉnh, cấp huyện, các cơ quan, tổ chức khác thuộc bộ máy hành chính nhà nước ở trung ương và địa phương (bao gồm cả các đơn vị sự nghiệp của Nhà nước); trên cơ sở đó điều chỉnh chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và tổ chức, sắp xếp lại các cơ quan, đơn vị nhằm khắc phục tình trạng chồng chéo, bỏ trống hoặc trùng lắp về chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn; chuyển giao những công việc mà cơ quan hành chính nhà nước không nên làm hoặc làm hiệu quả thấp cho xã hội, các tổ chức xã hội, tổ chức phi chính phủ đảm nhận”.

 Chính phủ, Thủ tướng Chính phủ đã tập trung chỉ đạo, sắp xếp, kiện toàn cơ cấu tổ chức Chính phủ theo hướng tinh gọn, giảm đầu mối, thực hiện tổ chức các Bộ, cơ quan ngang Bộ, cơ quan thuộc Chính phủ và cơ quan chuyên môn thuộc Ủy ban nhân dân các cấp theo mô hình quản lý đa ngành, đa lĩnh vực; tiến hành rà soát chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn, cơ cấu tổ chức của các Bộ, cơ quan ngang Bộ, cơ quan thuộc Chính phủ, Ủy ban nhân dân các cấp, các cơ quan chuyên môn thuộc Ủy ban nhân dân cấp tỉnh, cấp huyện, trên cơ sở đó điều chỉnh chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và tổ chức, sắp xếp lại các cơ quan, đơn vị để khắc phục tình trạng chồng chéo, bỏ trống hoặc trùng lắp về chức năng, nhiệm vụ; đồng thời hoàn thiện hệ thống pháp luật để quản lý chặt chẽ hơn về thành lập tổ chức.

Ngày 18/10/2012, Thủ tướng Chính phủ ban hành Quyết định số 1557/QĐ-TTg phê duyệt Đề án “Đẩy mạnh cải cách chế độ công vụ, công chức”. Một trong các nội dung đẩy mạnh cải cách chế độ công vụ, công chức là: Đẩy mạnh phân cấp quản lý và hoàn thiện việc tổ chức công vụ gọn, nhẹ. Giảm quy mô công vụ, sắp xếp tổ chức bộ máy gọn nhẹ, tránh chồng chéo, tiếp tục tinh giản biên chế, nâng cao chất lượng đội ngũ cán bộ, công chức. Xác định danh mục vị trí việc làm.