Tại phiên giải trình, Tổng thanh tra Chính phủ Huỳnh Phong Tranh khẳng định, tình hình tham nhũng đến nay đã có nhiều chuyển biến tích cực, tham nhũng trên một số lĩnh vực quản lý nhà nước đã từng bước được hạn chế. Tuy nhiên, một số lĩnh vực nhạy cảm như tín dụng, ngân hàng, quản lý và sử dụng đất đai, tài nguyên khoáng sản, đầu tư xây dựng, quản lý, sử dụng vốn tài sản nhà nước tại các doanh nghiệp vẫn còn tham nhũng với những biểu hiện tinh vi, phức tạp. Năm 2012, ngành thanh tra đã phát hiện 89 vụ, 107 người có hành vi tham nhũng với số tài sản gần 105 nghìn tỷ đồng. Theo báo cáo của Kiểm toán Nhà nước, từ năm 2009 – 2012, cơ quan này đã tiến hành kiểm toán 136 đầu mối là các tập đoàn, tổng công ty nhà nước, tổ chức tài chính; phát hiện nhiều hạn chế, thiếu sót trong sử dụng vốn, quản lý tỷ lệ nợ quá hạn, hiệu quả đầu tư thấp, cơ chế bù đắp chênh lệch lãi suất và chi phí quản lý đối với ngân hàng chính sách còn nhiều bất cập... Đại diện Bộ Tài chính cho biết, Bộ đã tập trung hoàn thiện thể chế, chính sách pháp luật về quản lý kinh tế, tài chính, thực hiện cải cách hành chính, chuyển đổi vị trí công tác của cán bộ, công chức, thực hiện minh bạch về tài sản, thu nhập... Kết quả thanh tra, kiểm tra, kiểm soát của toàn ngành tài chính từ năm 2009 đến hết quý I.2013 đã phát hiện và kiến nghị xử lý về tài chính trên 32.735 tỷ đồng. Các cơ quan chức năng cũng thừa nhận, công tác phát hiện và xử lý hành vi tham nhũng vẫn còn nhiều hạn chế, khó khăn, thiếu các quy định về biện pháp bảo đảm thi hành các quyết định, kết luận thanh tra, kiểm tra; một số kiến nghị, kết luận của kiểm toán và thanh tra chưa rõ ràng, chưa thuyết phục...
Kết luận phiên giải trình, Chủ nhiệm Ủy ban Tư pháp Nguyễn Văn Hiện cho rằng, nhiều vấn đề liên quan tới công tác phòng ngừa, phát hiện và xử lý tham nhũng thuộc trách nhiệm của cơ quan hành chính Nhà nước đã được các cơ quan hữu quan giải trình, làm rõ hơn, nhất là về tình hình tham nhũng, kết quả cuộc đấu tranh phòng, chống tham nhũng, việc phát hiện và xử lý hành vi tham nhũng, những việc chưa làm được, tồn tại, nguyên nhân và trách nhiệm của các cơ quan hữu quan trong công tác này. Tuy nhiên, nguyên nhân khiến việc phát hiện và xử lý hành vi tham nhũng của các cơ quan hành chính Nhà nước còn chưa đạt yêu cầu không chỉ do cơ chế, chính sách, pháp luật, tính chất của tội phạm tham nhũng... mà còn do sự lãnh đạo, chỉ đạo của các cấp, ngành, người đứng đầu các cơ quan, tổ chức còn chưa thực sự quyết liệt, sát sao và thường xuyên. Cùng với đó là trách nhiệm công vụ của từng vị trí công tác, cơ chế quy trách nhiệm khi có vi phạm, tham nhũng xảy ra chưa được củng cố và tăng cường, cơ chế xin – cho vẫn tồn tại... cũng là nguyên nhân khiến tình trạng tham nhũng chậm được khắc phục.