Trong hơn 20 năm qua với một loạt các biện pháp cải cách, Việt Nam đã có những tiến bộ đáng kể trong việc thực hiện mục tiêu bao phủ y tế toàn dân. Tính đến cuối năm 2013, đã có 68% dân số tham gia BHYT. Tuy đã đạt được những kết quả đáng kể nhưng tiến độ thực hiện các mục tiêu chính còn chậm, tỷ lệ tham gia BHYT còn thấp, kể cả ở những đối tượng bắt buộc như người có việc làm chính thức. Việc thực hiện Luật BHYT trong 5 năm qua đã bộc lộ những hạn chế về tổ chức và quản lý BHYT. Đơn cử như mục tiêu cốt lõi của BHYT là cung cấp bảo vệ về tài chính cho người dân khi tiếp cận hàng hóa, dịch vụ y tế cần thiết, có chất lượng lại chưa được nhấn mạnh trong Luật hay các văn bản dưới Luật; cơ quan quản lý BHYT quy định trong Luật BHYT chưa được thành lập. Thay vào đó, Bảo hiểm xã hội Việt Nam được giao nhiệm vụ triển khai chương trình BHYT, trong khi đây không phải là cơ quan chuyên trách riêng về BHYT. Bên cạnh đó, chức năng của Bộ Y tế về BHYT còn chưa rõ ràng, thậm chí mâu thuẫn, chưa được phân định cụ thể về mặt pháp lý.
Các đại biểu cho rằng, trong quá trình sửa đổi Luật BHYT tới đây, cần nghiên cứu xác định mục tiêu, nhiệm vụ của BHYT là một công cụ tài chính để thực hiện bảo phủ y tế toàn dân. Trong đó, xác định rõ mục tiêu, nhiệm vụ của cơ quan BHYT là tập hợp, huy động nguồn thu từ cá nhân, đối tượng sử dụng lao động và Nhà nước nhằm chi trả cho việc cung cấp những gói hàng hóa, dịch vụ y tế định sẵn. Mặt khác, cần điều chỉnh và quy định rõ chức năng, nhiệm vụ của những cơ quan chính như Bộ Y tế, Bảo hiểm xã hội trong quản lý BHYT nhằm giảm thiểu sự phân tán về tổ chức và chồng chéo về chức năng.