Mặc dù cho rằng dự án Luật Thuế giá trị gia tăng (sửa đổi) bảo đảm các yếu tố như: Đơn giản, rõ ràng, minh bạch, góp phần thúc đẩy cải cách hành chính, nâng cao hiệu quả công tác quản lý thuế, tính tuân thủ pháp luật về thuế và đồng bộ với Luật Quản lý thuế nhưng nhiều đại biểu cho rằng đối với lĩnh vực vật tư nông nghiệp và các mặt hàng trọng yếu khác, đề nghị ban soạn thảo cân nhắc mức thuế suất để góp phần ổn định đời sống nhân dân, đẩy nhanh xã hội hóa. Bên cạnh đó, cần phải có lộ trình cụ thể cho việc áp dụng hình thức thanh toán qua ngân hàng.
Về dự thảo Luật Thuế thu nhập doanh nghiệp (sửa đổi), có ý kiến cho rằng còn một số điều còn rườm rà trong câu chữ, giảm thuế sẽ ảnh hưởng tới nguồn thu song có thể bù lại bằng tăng trưởng kinh tế.