Đa số đại biểu đều nhất trí với tên gọi và phạm vi điều chỉnh, sự cần thiết phải ban hành Luật này. Tuy nhiên, có ý kiến cho rằng, dự thảo Luật còn quá nặng về khung; mục giải thích từ ngữ còn quá ít, trong khi rất nhiều từ ngữ như: tài nguyên, khoáng sản, khí thiên nhiên, nước thiên nhiên là gì… chưa được đưa vào trong đề mục giải thích. Việc liệt kê danh sách đối tượng chịu thuế cần cụ thể hơn. Về kê khai tính thuế, quyết toán thuế tài nguyên, nhiều ý kiến cho rằng đã khai thác tài nguyên thì dứt khoát phải chịu nộp thuế. Song, việc quy định một mức thuế là rất khó trong việc điều hành quản lý Nhà nước đối với các tỉnh. Tại khoản 4, 5 Điều 10, nhiều ý kiến cho rằng, việc miễn thuế sử dụng nước tự nhiên cho người dân là lâu dài, do vậy nên đưa đối tượng này vào mục đối tượng không chịu thuế để giảm thủ tục hành chính, tránh phiền hà cho người dân…